研究生实践课程西部行： 生物大数据分析公益培训班在塔里木大学成功开设

为响应中西部高等教育振兴计划，推进东部高校对口支援西部高校计划中的实践育人工作，在中国海洋大学与塔里木大学的前期良好合作基础上，2024年8月14至17日，由中国海洋大学水产学院和海洋生物多样性与进化研究所共同主办、面向青年科研人员的《生物大数据分析》研究生实践课程首次走出海大校园，在塔里木大学成功开设。尽管课程密集、部分授课成员身体不适且天气炎热，但授课团队和学员们经过四天的共同努力，仍然取得了良好的培训效果。该培训班由进化基因组学实验室负责人龙红岸教授全盘牵头组织，全程得到了华为技术有限公司、翌圣（生物）科技有限公司等的大力协助。本培训课程最初由教育部-华为技术有限公司-中国海洋大学三方支持的“产学合作协同育人-新工科建设项目（A类）”（2020）立项建设，至今已开设6期，累计培训学员238人。

全体合影

组学技术为生物学提供了一把牛刀，但产出的大量数据却因分析软硬件技术门槛高，外包服务商良莠不齐，导致数据堆积和缺乏深度个性化分析。授课团队期望为非生物信息学背景实验室扫清部分技术障碍，与零基础研究生分享针对大数据分析的学习方法与操作技术，结课时可独立进行基本的生物大数据分析和结果解释，以修课学生为桥梁，为有需求的实验室引入技术火种，最终推动泛生命学科研究水平的整体提升。

一个人可以走很快，一群没有私心的人才能走很远。分享利他，太多人只是放在口头上，而缺乏行动。技术总会过时，但通过分享技术结下的友谊却可以持续一生。授课团队由进化所高性能服务器运维团队、进化基因组学课题组全体师生和本科生志愿者共计10人组成。授课团队在前五期的授课基础上，进行了精心的筹备，更新了课程内容，集中研讨了授课形式和全流程资源配置，再加上专业指导和多方赞助支持，延续了之前完整的授课体系。1:3的高师生比也保证了对学员实际操作的及时对接，修课学员还需自学指定的Linux教材且由授课团队成员一对一严格考核掌握程度，最终有25名学员完成全部培训内容并获得水产学院、进化所共同认证的结业证书，绝大多数学员来自不同实验室。

授课团队行前准备

培训过程中，学员们热情高涨，操作认真，并结合自身研究方向积极提问，与授课人员及助教有着良好的互动。操作内容涵盖了从科研方法论、虚拟机和服务器的使用与软件安装、测序原理、数据预处理、基因组组装注释、基于转录组测序的表达量差异分析、扩增子分析、宏基因组学、数据可视化等生物大数据分析基础理论与上手操作。

授课团队、塔里木大学生命科学与技术学院领导班子和优秀学员合影

课程表

教室：塔里木大学新国重室B204

授课团队：中国海洋大学进化基因组学课题组

经过四天全天候的上手集训，学员们不仅了解了高性能服务器的架构体系及生态环境，也掌握了生物大数据分析相关技能及学习方法，能进行分子、基因组和群落各层次的基本大数据分析，并扩大了自己的科研朋友圈。其中李超、杨果、杨秋红三名学员表现突出，被评为白金学员，其余同学被评为黄金学员。

“为实验室引入技术火种，打造同学心目中的实用型金课”是《生物大数据分析》公益培训班的开设初衷，也是授课团队将一直秉承的理念。相信未来的《生物大数据分析》将会不断升级，为更多的学员带来掌握上手技能的机会，成为同学们心目中的实用型金课！也希望本培训课程能抛砖引玉，启发更多课程改革，共同推进中国研究生教育质量的持续提升。