本次评选工作于2011年11月启动，评选对象为2009年9月至2010年8月间博士学位获得者的学位论文。海大研究生院组织各学院学位评定分委员会开展推荐及申报工作。经山东省学位委员会初选、教育部组织同行专家通讯评议、国务院学科评议组专家会议复审和网上公示，海洋环境学院吴立新教授指导的2006级博士生李春的论文《北太平洋风生环流变异及其对大气环流的反馈》、水产学院宋微波教授指导的2006级博士生伊珍珍的论文《旋唇纲、寡膜纲和前口纲纤毛虫原生动物研究：系统发育中的亲缘关系探讨》及水产学院李琪教授指导的2005级博士生于红的论文《牡蛎良种选育的遗传学基础研究》获全国优秀博士学位论文提名。

    据悉，2012年教育部共评选出全国优秀博士学位论文90篇，提名论文278篇。自教育部1998年设立此奖项以来，海大共有4篇论文获得全国优秀博士学位论文，8篇获得提名资格。