意大利比萨大学Giulio Petroni教授和Valentina Serra博士近日到访海洋生物多样性与进化研究所，实地参观了进化所的各个实验室，并于6月23日上午在敏行馆B楼会议室分别做了题为“Metabarcoding for Biodiversity Assessment: From Bacteria to Vertebrates”和“Next Generation Taxonomy of Ciliophora: A Checkpoint after Six Years of Experience”的学术报告。
Petroni教授首先分享了其团队利用环境DNA（eDNA）和宏条形码技术对污水处理厂微型生物群落的研究成果。研究发现，原生生物沿磷梯度呈规律性变化：适度的磷限制能维持最多样化的营养结构，捕食性和滤食性原生生物对细菌种群具有调控作用；而过度的磷限制则使群落简化，导致单一纤毛虫成为优势类群。此外，较短的沉积时间虽增加细菌多样性，却降低了原生生物的整体多样性。该研究将污水处理系统从“黑箱”转化为可透视的微食物网，为生态调控机制提供了新视角。
随后，Petroni教授以当地某河流区域为采样地，分享了主动与被动采样方法对生物多样性评估的影响。研究发现，两种eDNA采样方式所获取的生物多样性信息存在明显差异。被动采样结合18S和12S标记能检测到更多分类单元，尤其对微型无脊椎动物具有较高灵敏性；而主动过滤在鱼类检测方面表现更优，但对脊椎动物的整体检出水平两者相当。因此，被动采样适用于大规模生物多样性调查，而主动过滤在有针对性的鱼类监测中仍具独特价值。实际应用中需根据监测目标和资源条件灵活选择适宜方法。
Serra博士向大家介绍了欧盟“地平线2020”计划（Horizon 2020）《Next Generation Taxonomy: Ciliophora and their bacterial symbionts as a proof of concept》（下一代分类学：纤毛虫及其细菌共生体的概念验证）的国际合作与交流项目。该合作项目为期6年（2020-2026），核心目的是整合经典形态学分析、超微结构、分子工具、基因组学和生物信息学等技术，探索并扩展新一代纤毛虫及其共生体分类学的理念，在欧盟、非洲、中国等建立一个国际和跨部门的组织网络。该项目参加人员来自欧洲各国、中国、肯尼亚、埃塞俄比亚、南非等国家的多家高校和科研单位。进化所原生动物学团队作为中方合作者参加了该项目，负责其中纤毛虫经典形态分类、基因组等生物信息学分析、纤毛虫综合分类方法的人员培训等任务。
Giulio Petroni教授作报告
Valentina Serra 博士作报告
Giulio Petroni 博士，意大利比萨大学生物系教授，意大利动物联盟(UZI) “Renzo Nobili” 奖获得者。长期从事原生生物学和微生物多样性研究，主要关注纤毛虫、细菌共生体及宿主-微生物共生的进化机制，研究还涵盖环境监测、eDNA宏条形码及水生生态系统生物多样性评估，并致力于整合形态学、分子系统发育、基因组学和微生物学的研究方法。先后主持欧盟玛丽·居里计划（MSCA）、意大利国家重大利益项目计划（PRIN）等，先后在PNAS、Nature Communications、ISME Journal等国际主流期刊发表研究论文百余篇。
Valentina Serra 博士，意大利比萨大学生物系终身研究员，主要从事纤毛虫及其细菌共生体的综合分类学研究，整合了经典显微技术、超微结构观察、分子系统发育和基因组学方法。积极参与了欧盟“地平线2020”计划（Horizon 2020）《Next Generation Taxonomy: Ciliophora and their bacterial symbionts as a proof of concept》，负责科学协调、培训及国际合作中的分类学知识传授。此外，她还致力于生物多样性科普和公民科学项目，旨在推动研究与公众参与、环境意识相结合。
